Thảo luận tại phiên họp tư vấn thẩm định, các thành viên Hội đồng có nhiều ý kiến góp ý cụ thể về nội dung dự thảo Quyết định, đặc biệt là một số vấn đề hiện vẫn còn có ý kiến khác nhau, bao gồm:  
Về nhiệm vụ, quyền hạn của Ủy ban ATGT Quốc gia (Điều 2 Dự thảo Quyết định): cần nghiên cứu, rà soát, biên tập các nhiệm vụ của Uỷ ban ATGT Quốc gia thành 03 nhóm chính theo Quyết định 34/2007/QĐ-TTg, trong đó cần làm rõ trách nhiệm của Ủy ban ATGT Quốc gia với cơ quan nhà nước có thẩm quyền trong việc chỉ đạo, điều hòa, phối hợp giải quyết các vấn đề an toàn giao thông.
Về tổ chức của Ủy ban ATGT Quốc gia (khoản 1 Điều 3 Dự thảo Quyết định): đề nghị Lãnh đạo Ủy ban chỉ cần: Chủ tịch, 02 Phó Chủ tịch của Bộ Công an và Bộ Giao thông vận tải; không đặt chức danh Phó Chủ tịch chuyên trách; các Ủy viên Ủy ban cần tính toán số lượng vừa phải, còn lại thực hiện theo chỉ đạo bằng văn bản của Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ và Chủ tịch Ủy ban ATGT Quốc gia, không cần nhiều thành phần khác tham gia.
Về Văn phòng Uỷ Ban ATGT Quốc gia (Điều 4 Dự thảo Quyết định): Cần tập trung kiện toàn, nâng cấp Văn phòng Ủy ban gồm Chánh Văn phòng, khoảng 03 Phó Chánh Văn phòng và các chuyên gia đại diện cho các Bộ, ngành, tổ chức chính trị - xã hội, không nên chỉ sử dụng cán bộ của ngành giao thông như hiện nay. Củng cố tốt Văn phòng Ủy ban thì Ủy ban ATGT Quốc gia hoạt động hiệu quả hơn. Do vậy, cần xây dựng tiêu chuẩn các chức danh của Văn phòng Ủy ban để bố trí cán bộ có đủ năng lực, trình độ đáp ứng công việc, nhất là phải chọn được Chánh Văn phòng, các Phó Chánh văn phòng thật sự có năng lực, vô tư khách quan.
Về nhiệm vụ, quyền hạn của Ban An toàn giao thông, tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương (Điều 7 Dự thảo Quyết định): Đề nghị cơ quan chủ trì soạn thảo thiết kế thống nhất như đối với nhiệm vụ, quyền hạn của Ủy ban ATGT Quốc gia, bảo đảm phù hợp với quy định tại Điều 6 Quyết định số 34/22007/QĐ-TTg.
Về vị trí của Văn phòng Ban An toàn giao thông tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương (khoản 3 Điều 8 dự thảo Quyết định): Cần xác định rõ Văn phòng Ban An toàn giao thông tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương là đơn vị “thuộc” hay “trực thuộc” Ban An toàn giao thông tỉnh.
Phát biểu kết luận cuộc họp tư vấn thẩm định, Chủ tịch Hội đồng tư vấn thẩm định đã tóm tắt và nêu ý kiến của Hội đồng tư vấn thẩm định về các nội dung đã phát biểu tại cuộc họp, đồng thời đề nghị cơ quan chủ trì soạn thảo nghiên cứu kỹ ý kiến góp ý về từng vấn đề để tiếp tục chỉnh lý hoàn thiện dự thảo Quyết định, nhằm nâng cao chất lượng của dự thảo văn bản trước khi trình Thủ tướng Chính phủ. Trên cơ sở kết quả cuộc họp Hội đồng tư vấn thẩm định, Bộ Tư pháp sẽ khẩn trương hoàn thành văn bản thẩm định trình Lãnh đạo Bộ xem xét ký ban hành.